ムジェロでのイタリアグランプリに向けて、MotoGPチャンピオンシップの現リーダーであるホルヘ・マルティンがポールポジションを獲得しました。この成果は、強力な競争相手であるマルク・マルケスがマルティンのタイムを上回る可能性のあるラップ中にクラッシュしたため、さらに重要なものとなりました。マルケスは最初の試みではペドロ・アコスタを追いかけながら立派なタイムを記録しましたが、2回目の試みでは不利なポジションに立たされました。しかし、彼はミゲル・オリベイラを追い越す大胆な動きを見せ、フランコ・モルビデリを追いかけて残りのラップの参考にしようとしました。残念ながら、マルケスはスカリペリアでクラッシュし、ポールポジションを獲得するチャンスを逃しました。マルティンの最初のラップタイム1分44.504秒は、2回目の試みで改善することはありませんでしたが、ポールポジションを確保するのに十分でした。
現チャンピオンであるペッコ・バニャイアも2回目の試みでの改善に失敗し、金曜日のセッションでアレックス・マルケスの妨害による3グリッドポジションのペナルティを受けて5番グリッドからレースをスタートします。ただし、このペナルティはフルレースにのみ適用されるため、スプリントレースでは依然として2番グリッドからスタートします。アプリリアのマーベリック・ビニャーレスは、最初の試みでバニャイアを密接に追いかけて3番目のタイムを獲得しました。終盤にタイムを改善する脅威を見せましたが、結局はやや遅いタイムで満足することになり、それでもフロントローに並ぶことができました。
クラッシュにもかかわらず、マルケスはマルティンとビニャーレスの後ろ、バニャイアの前でイタリアグランプリを3番グリッドからスタートします。バニャイアのチームメイトであるエネア・バスティアーニは5番グリッドを獲得し、Q1で既にラップレコードを更新していたフランコ・モルビデリは6番グリッドでフィニッシュしました。Q2で唯一のKTM/Gas Gas RC16ライダーであるペドロ・アコスタは7番グリッドでフィニッシュしました。若手のマルケスとアプリリアのアレイシ・エスパルガロが3列目を埋めます。
アレックス・リンスは、ヤマハチームをリードし、10位を獲得しました。続いて、トラックハウス・アプリリアのミゲル・オリベイラとラウル・フェルナンデスが続きました。フェルナンデスは、Q1でのパフォーマンスに合わせていれば、2列目にいたでしょう。ゲストライダーのポル・エスパルガロのクラッシュにより、イエローフラッグが出され、ファビオ・ディ・ジャンナントニオのQ2進出のチャンスに影響を与えました。ディ・ジャンナントニオはグリッドで14位でフィニッシュしました。
ファビオ・クアルタラロは、2番目のヤマハを駆っており、ヤマハの改善されたパフォーマンスと彼自身の強いレースペースにもかかわらず、Q2のスポットをわずかに逃し、15位でスタートします。VR46チームのクアルタラロのチームメイト、マルコ・ベッツェッキは16位でフィニッシュし、トップのホンダライダーとしてジョアン・ミールが続きます。ミールはクアルタラロからタイムリーなスリップストリームを受け、ジョハン・ザルコの到着以来のトップのホンダライダーの連勝を終わらせました。
ジャック・ミラーは、2番目の公式KTMでのパフォーマンスが悲惨で、19位でフィニッシュしました。彼の直後には、テック3ガスガスのアウグスト・フェルナンデスとゲストライダーのエスパルガロが続きました。後者はクラッシュしたにもかかわらず、彼に続いています。
